Ouverte dans le courant du XIIIe siècle, cette voie porta longtemps le nom de Rue d'Orléans, ou Rue d'Orléans-Saint-Marcel. En 1864, elle reçoit le nom de ce naturaliste, à l'origine de l’essor du Cabinet de Curiosités du Roi, qui formera les bases du futur Muséum national d’histoire naturelle voisin. On notera par ailleurs que Daubenton était un collègue et ami de Buffon, dont la rue éponyme est également voisine.
Louis Jean-Marie d’Aubenton dit Daubenton
(Montbard, 29 mai 1716 - Paris, 31 décembre 1799)
Garde-démonstrateur au Cabinet du Roi (1745)
Professeur au Collège de France (1778)
Membre de la Société Royale de Londres (1755)
Membre de l'Académie des Sciences (1795)
Sénateur (1799)
D'azur, à trois peignes d'or.
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